[硕士论文] 牛GlyCAM1基因的多态性与乳腺炎关联性分析 [复制链接]

资料简介：
硕士论文-牛GlyCAM1基因的多态性与乳腺炎关联性分析，共53页，27865字

摘要

本实验以319头中国荷斯坦牛、68头鲁西黄牛及40头渤海黑牛为研究对象，利用

PCR-SSCP、CRS-PCR以及DNA测序技术检测了GlyCAM1基因的遗传多态，并采用最小

二乘法拟合线性模型将各基因座不同基因型与奶牛乳腺炎进行了关联分析,结果表明br />
1、本研究首次发现牛GlyCAM1基因存在5个新SNP，分别为5’UNT第602位点存在

T/A突变，内含子1第1489位点存在C/G突变、在内含子2第2239位点存在T/G突变、在外

显子3第3095位点存在A/C突变、在内含子3 第3431位点存在C/T突变。

2、采用DraI、HindIII、MspI、Hin1II和Tru1I酶切方法检测五个位点等位基因的多

态性。结果显示，中国荷斯坦牛群体中五个位点的优势基因型为AA、优势等位基因为A。

鲁西黄牛及渤海黑牛3095位点的优势基因型均为AB，优势等位基因分别为A、B；3431

位点优势基因型均为AA，优势基因均为A，中国荷斯坦牛和鲁西黄牛在此位点未检测到

BB基因型。

3、经χ2适合性检验，中国荷斯坦牛5个SNP位点仅3095位点基因座未达到

Hardy-Weinberg平衡状态( P > 0.05) 。鲁西黄牛和渤海黑牛在3095和3431两位点基因座

位均达到Hardy-Weinberg平衡状态( P <0.05)。

4、采用最小二乘法拟合线性模型将该基因座不同基因型与奶牛乳腺炎进行了关联

分析, 结果表明胎次效应、场效应和泌乳月效应对乳腺炎的影响较大( P < 0.01)。602位

点基因型效应对SCS的影响未达到了显著水平( P >0.05) ，1489位点和2239位点BB基因

型的SCS显著高于AB和AA基因型，3095位点BB和AB基因型SCS显著高于AA基因型。

因此，可将1489、2239、3095三个位点AA基因型作为抗乳腺炎性状的优良基因型。

关键词：牛；GlyCAM1 基因；遗传多态性；SCS；乳腺炎；CRS-PCR；PCR-SSCP

目录

中文摘要……... …...........…..1

英文摘要………..………........ . .……………2

前言……………..…………............…………4

1 奶牛乳腺炎的研究概况…...……….....…..4

1.1 乳腺炎的定义和分类…...…….........…...4

1.2 奶牛乳腺炎的危害…...…………….…...5

1.3 乳腺炎的发病原因…... …...........……...5

1.4 奶牛乳腺炎的诊断…...……………..…..6

1.5 乳腺炎遗传学研究进展…………….......8

1.6 GlyCAM1基因的研究进展…...…….....10

1.7 PCR-SSCP技术….............……………..12

1.8 SNP的研究现状.........……………..........……………...13

1.9 研究的目的和意义..........……………..13

研究内容……..........………..15

1 试验材料…….........……...15

1.1 试验动物.15

1.2 试验仪器…... …...........……….............15

1.3 主要试剂及试剂的配制…... …............16

2 试验方法…...… …............18

2.1 基因组DNA的提取与检测…...… …...........………….18

2.2 PCR扩增及扩增结果检测…...……...........……………19

2.3 PCR产物SSCP分析、酶切及测序…... …...........…….21

2.4 统计分析…... …............21

3 结果与分析…... …............23

3.1 模板DNA抽提结果…... …...........…….23

3.2 GlyCAM1基因的基因分型及测序分析…... …............23

3.3 中国荷斯坦牛、鲁西黄牛、渤海黑牛 GlyCAM1 基因多态性分析…...……………33

3.4 中国荷斯坦牛GlyCAM1基因多态性与乳腺炎相关性分析…...…....34

4．讨论…...…….. …............37

4.1 单核苷酸多态性（SNP）…...…...........……………...37

4.2 GlyCAM1 基因的多态性…...…..............38

4.3 群体多态信息含量、群体杂合度…...……...........……38

4.4 Hardy-Weinberg 平衡状态分析…...… …...........…….39

4.5 GlyCAM1基因与中国荷斯坦牛乳腺炎关联性的分析…...………….39

4.6 PCR扩增及PCR-SSCP的注意事项..........…………….39

5 结论……..........…………..41

参考文献……42

致谢…………… . ………….46

资料文件预览：
共1文件夹，1个文件，文件总大小：1.81MB，压缩后大小：1.04MB

• 硕士论文-牛GlyCAM1基因的多态性与乳腺炎关联性分析
• 硕士论文-牛GlyCAM1基因的多态性与乳腺炎关联性分析.doc  [1.81MB]