[硕士论文] 野猪及其杂交猪群体遗传多样性和遗传分化的研究 [复制链接]

资料简介：
硕士论文-野猪及其杂交猪群体遗传多样性和遗传分化的研究，共58页，36101字

摘 要

家畜物种内(包括品种间和品种内)存在的遗传变异是家畜品种不断发展和改良的

基础，深入研究和有效保护畜种内的遗传变异对畜牧业的可持续发展有着重要意义。本

研究采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术，通过对IGFBP3、LEPTIN、ZP3、MC4R及H-FABP

这5个结构基因遗传变异的检测，分析了野猪、杜洛克、长白及野猪与杜洛克、野猪与

长白的杂交后代5个猪群体的遗传多样性和遗传分化，结果表明：

1． 在 H-FABP、LEPTIN 这两个位点上野猪与杜洛克、长白群体优势等位基因不同；

MC4R 位点所有群体中 C 等位基因均以较高频率存在，野猪最高、长白最低；在 IGFBP3

位点上，野猪与长白、野猪与长白的杂交后代一致，而与杜洛克、野猪与杜洛克的杂交

后代则正好相反；在 ZP3 位点上，野猪与长白的杂交后代与野猪均未出现 BB 基因型，

在 MC4R 位点上，野猪与长白的杂交后代与野猪均未出现 AA 基因型。

2.

Hardy-Weinberg 检验表明：5 个位点中除野猪在 H-FABP、野猪与长白的杂交后

代在 IGFBP3 处于遗传极不平衡状态，野猪与杜洛克的杂交后代在 IGFBP3、MC4R、ZP3

杜洛克在 ZP3 处于遗传不平衡状态外，其他群体均处于遗传平衡状态。

3．5 个群体的平均位点杂合度在 0.2866-0.4318 之间，野猪最低，野猪与杜洛克的

杂交后代最高；平均多态信息含量在 0.14-0.38 之间，野猪最低，野猪与杜洛克的杂交

后代最高。平均位点杂合度和平均多态信息含量的结果基本一致。

4．Fst 衡量等位基因频率群体间方差，野猪、杜洛克及野猪与杜洛克的杂交后代这

三个群体间总变异的17.9 %来自种群间，而剩余的 82.10 % 来自种群内；野猪、长白及

野猪与长白的杂交后代这三个群体间总变异的27.1 % 来自种群间，72.9 %来自种群内，

因此，野猪与杜洛克或长白及野猪与它们的杂交后代的遗传分化均处于处于中等以上

（Fst＞0.15）。

5. 群体间Reynolds'遗传距离显示，杜洛克与野猪的遗传距离比长白与野猪大，可认

为杜洛克与野猪杂交产生的杂种优势较大。

关键词：野猪，PCR-RFLP；PCR-SSCP；遗传多样性；遗传分化

目录

中文摘要…………1

英文摘要…………2

前言………………1

1 文献综述..............3

1.1 群体遗传结构的研究方法...............3

1.2 我国猪群体遗传多样性和遗传关系的研究...7

1.3 野猪资源现状.10

1.4 各结构基因位点研究进展.............14

2 材料与方法........15

2.1 试验材料.........15

2.1.1 试验动物......15

2.1.2 试验试剂......16

2.1.3 仪器设备......18

2.2 试验方法.........19

2.2.1 组织 DNA 的提取、分离与检测 ...............20

2.2.2 限制性片段长度多态性 DNA 标记（PCR-RFLP） ...............21

2.2.3 单链构象多态性 DNA 标记（PCR-SSCP）............21

2.3 数据统计及分析方法.....22

2.3.1 基因型频率和基因频率..............22

2.3.2 单个基因位点的遗传平衡检验..23

2.3.3 群体遗传多样性及遗传分化的检测..........23

3 结果与分析........24

3.1 各猪群体 2 个基因位点的 PCR-RFLP 检测结果.......25

3.1.1 心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP).........25

3.1.2 黑素皮质受体 4 (MC4R)............26

3.2 各群体 3 个基因位点的 PCR-SSCP 检测结果 ...........26

3.2.1 IGFBP3 基因 ...............27

3.2.2 Leptin 基因 ..28

3.2.3 ZP3 基因.......28

3.3 数据统计与分析.............29

3.3.1.基因和基因型频率及群体遗传平衡性检验...............29

3.3.2 各群体总的遗传纯合度和遗传杂合度.......30

3.3.3 各群体的平均杂合度和平均位点杂合度..31

3.3.4 各群体的平均多态信息含量 PIC..............31

3.3.5

5 个猪群体的 F-指数结果 ........32

4 讨论....33

4.1 关于 PCR-RFLP 技术分析...........34

4.2 关于 PCR-SSCP 技术分析 ...........35

4.3. 关于 H-FABP-Hae Ⅲ-RFLP 酶切位点分析 ..............36

4.4. 关于 MC4R- TaqⅠ-RFLP 酶切位点分析..36

4.5 遗传多样性分析.............37

4.6 群体的遗传分化............38

4.7 纯种间的遗传距离与杂种优势....38

4.8 利用 RFLP 数据进行物种间遗传分化研究的可行性 ...............38

结论…………….39

参考文献……… 40

致谢…………….45

攻读硕士论文期间发表的学术论文……….46

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