[硕士论文] 13/17罗伯逊易位猪POU1F1基因的多态性及其与经济性状的相关分析 [复制链接]

资料简介：
硕士论文-13/17罗伯逊易位猪POU1F1基因的多态性及其与经济性状的相关分析，共70页，36412字

摘 要

POU1F1 为 POU 结构域蛋白家族的成员之一，是动物垂体前叶特异表达的一种具有重

要功能的转录因子，它正向调节着哺乳动物生长激素（GH）、催乳素（PRL）、促甲状腺

素（TSH-β）的代谢，在调控动物生长发育和繁殖上有重要作用。

试验选取 13/17 易位杂合子猪×13/17 易位杂合子猪、皮杜×13/17 易位杂合子猪、

约克×13/17 易位杂合子猪 3 种杂交组合的 394 头后代，采用外周血淋巴细胞培养制备

染色体标本进行核型分析；对 POU1F1 基因的 DNA 多态性进行 PCR-SSCP 和 PCR-RFLP 检

测分析，寻找多态位点与生长、胴体组成等经济性状间可能存在的相关性。研究结果如

下：

1 对供试猪群进行核型分析，出现三种核型猪，分为 3 种核型群：13/17 易位纯合

子[2n=36，XY 或 XX，rob(13;17)]31 头、13/17 易位杂合子[2n=37，XY 或 XX，

rob(13;17)]183 头和正常核型猪[2n=38，XY 或 XX]180 头。

2 对 3 种杂交组合后代应用 PCR-RFLP 技术进行基因多态性分析，利用 Pst I、Rsa I

二种内切酶酶切 POU1F1 基因的包含部分内含子 4、全部外显子 5、内含子 5、外显子 6

及部分 3′侧翼的 1746 bp 扩增片段，检测到了一个 Rsa I-RFLP 多态位点 A，在此位点

上有 A1、A2 两个等位基因，3 种基因型（A1A1、A1A2、A2A2）。在 3 种杂交后代群中 A1

等位基因和 A1A1 基因型频率占优势，在 3 种核型群体中也是 A1 等位基因和 A1A1 基因

型频率占优势，其中 A1A2 基因型频率在易位杂合型群体中较高。该多态位点在各杂交

后代群中均未达到 Hardy-Weinberg 平衡，在不同核型群中亦处于非平衡状态。13/17

易位杂合子猪×13/17 易位杂合子猪和约克×13/17 易位杂合子猪两杂交后代群的 PIC

表现为中度多态，而皮杜×13/17 易位杂合子猪杂交后代群表现为低度多态；易位杂合

型群体表现为中度多态，正常核型和易位纯合型群体表现低度多态性。

3 应用 PCR-SSCP 技术，检测 POU1F1 基因的第 4 外显子和第 5 内含子。第 4 外显子

未检测到突变；第 5 内含子上检测到一个突变位点 E，出现 E1E1、E1E2 两种基因型。在

各杂交组合后代群和核型分类群中均为 E1 等位基因和 E1E1 基因型频率占优势，E1E2

基因型频率在易位纯合型群体中较高。该突变位点在各杂交组合后代群和不同核型分类

群中均处于 Hardy-Weinberg 非平衡状态。

4 结合各杂交组合后代生长和胴体组成的测定记录研究基因型对经济性状的遗传

效应，相关性分析出现显著差异。位点 A 的基因型对早期生长有显著影响（P<0.05），

位点 E 基因型对早期生长和眼肌面积有显著影响（P<0.05），初步研究揭示 POU1F1 基因

多态性与生长、眼肌面积等存在相关。

关键词：猪

罗伯逊易位

POU1F1 基因

核型

经济性状

目录

中文摘要......... 1

英文摘要......... 3

英文缩写词表. 5

第一章 文献综述....... 1

引言 .... 1

1 猪的育种方法......... 2

2 猪的育种目标......... 3

3 RFLP 技术 .. 3

4 单核苷酸多态性..... 4

5 PCR-SSCP 技术 ..... 4

6 家猪 13/17 罗伯逊易位 ..... 5

7 猪 13、17 号染色体上基因和标记的定位现状... 6

8 POU1F1（Pit-1）基因....... 6

第二章

猪群核型分析....... 12

1 试验材料和方法... 12

1.1 供试猪群 12

1.2 试验仪器 12

1.3 主要试剂及溶液配制.... 12

1.3.1 主要试剂......... 12

1.3.2 溶液配制......... 13

1.4 细胞培养及染色体标本制备.... 14

2 结果与分析........... 15

第三章 猪 POU1F1 基因 RFLP 分析 ....... 17

1试验材料和方法. 17

1.1试验材料.......... 17

1.1.1 供试猪群....... 17

1.1.2 试验主要仪器........... 17

1.1.3 主要试剂及溶液配制........... 17

1.1.4PCR 引物 ..... 19

1.2试验方法.......... 19

2试验结果分析..... 25

2.1 基因组 DNA 检测 ......... 25

2.2PCR 反应结果 25

2.3酶切分析.......... 26

2.4POU1F1 基因 RFLP 多态性与经济性状相关分析 . 29

第四章

猪 POU1F1 基因的 SSCP 分析 .. 31

1试验材料和方法. 31

1.1试验猪群.......... 31

1.2 主要仪器.......... 31

1.3 主要试剂及溶液配制.. 31

1.3.1 主要试剂....... 31

1.3.2 溶液配制....... 32

1.4试验方法.......... 32

2 试验结果分析..... 33

2.1PCR 反应结果 33

2.2 猪 POU1F1 基因第四外显子（159bp）扩增产物的 PCR-SSCP 分析 ..... 34

2.3 猪 POU1F1 基因第五内含子（218bp）扩增产物的 PCR-SSCP 分析 ..... 34

2.4 猪 POU1F1 基因的遗传多态性分析 . 34

2.5 猪 POU1F1 基因 SSCP 多态性与经济性状相关分析 ......... 35

第五章

讨论........... 37

1核型分析. 37

2PCR 扩增的影响因素 ... 37

3PCR-RFLP 分析 38

4PCR-SSCP 分析 39

5转录因子的调控和 POUIFI 基因的转录调节. 39

6群体 POU1F1 基因遗传多态性分析 .... 40

6.1RsaⅠ-RFLP 分析....... 40

6.2PstⅠ-RFLP 分析........ 40

6.3PCR-SSCP 分析 ......... 41

6.4Hardy-Weinberg 平衡检验.... 41

6.5遗传多态性分析.......... 41

7POU1F1 基因多态性与经济性状相关性分析 . 41

7.1RsaⅠ-RFLP 多态位点与经济性状相关性... 41

7.2SSCP 多态位点与经济性状相关性 ... 43

7.3POU1F1 基因与其他侯选基因的连锁 .......... 43

结论....... 45

参考文献....... 47

致谢......... 51

攻读硕士论文期间发表的学术论文........... 53

资料文件预览：
共1文件夹，1个文件，文件总大小：1.31MB，压缩后大小：403.32KB

• 硕士论文-13/17罗伯逊易位猪POU1F1基因的多态性及其与经济性状的相关分析
• 硕士论文-13／17罗伯逊易位猪POU1F1基因的多态性及其与经济性状的相关分析.doc  [1.31MB]