[硕士论文] 野猪群体结构基因遗传共适应特性的研究 [复制链接]

资料简介：
硕士论文-野猪群体结构基因遗传共适应特性的研究，共69页，40182字

摘 要

群体基因库的遗传共适应特性是在系统演化过程中逐渐形成的，和各基因位

点的基因频率一样，是基因库属性的一个方面。本研究对吉林、黑龙江、辽宁三

省的东北野猪进行随机采样，共采取野猪组织样本 42 个，利用 PCR-SSCP 和

PCR-RFLP 技术对其 Nanog、Leptin、胰岛素样生长因子蛋白 3、JAK2、肠毒素

大肠杆菌受体、心脏脂肪酸结合蛋白、钙蛋白酶抑制蛋白、组织蛋白酶 D、成骨

细胞特异因子、白色位点（KIT 基因）、肌细胞生成素、垂体转录因子、NRAMP1、

乳铁蛋白、运铁蛋白 15 个结构基因位点进行了多态性检测，并对多态性基因位

点进行了群体遗传共适应性分析，获得了如下结果：

1. 15 个结构基因位点中，有 Nanog、Leptin、胰岛素样生长因子蛋白 3、JAK2、

肠毒素大肠杆菌受体、心脏脂肪酸结合蛋白、钙蛋白酶抑制蛋白 7 个基因位点存

在不同程度的多态性，多态性比例为 46.67%。

2. 7 个多态性基因位点中，有 JAK2、肠毒素大肠杆菌受体、心脏脂肪酸结

合蛋白、钙蛋白酶抑制蛋白 4 个处于遗传不平衡状态，占所检测多态性基因位点

的 57.14%。

3. 位于不同染色体上的基因位点之间的 18 个组合中有 Nanog-JAK2、

JAK2-Leptin、JAK2-IGFBP3、JAK2-CAST、JAK2-H-FABP、JAK2-ECF18R 6 个组

合处于遗传不平衡状态，其主要原因是遗传共适应的作用,而且起主要作用的是

JAK2 基因。

4. 位于同一条染色体上的三个基因位点之间的 3 个组合都处于遗传平衡状

态，但是 Leptin-ECF18R 组合处于连锁不平衡状态，这是因为遗传共适应和基因

间的连锁作用的方向是相反的，两者共同作用使得两位点处于遗传平衡状态。

关键词：遗传共适应；遗传平衡；结构基因；野猪

目 录

中文摘要 ..... ..

英文摘要 ……… ….

前言 …………..…………….

文献综述....

1.1 野猪资源现状….

1.2 遗传共适应性的研究现状…………

1.2.1 遗传共适应问题的由来及概念的提出……………….

1.2.2 遗传共适应数学模型的建立与发展………………….

1.2.3 动物遗传共适应的研究进展…….

1.2.4 遗传共适应目前存在的问题……

1.3 各结构基因位点研究进展……….

1.3.1 Nanog 基因..

1.3.2 Leptin 基因….

1.3.3 胰岛素样生长因子蛋白 3 基因..

1.3.4 JAK2 基因….

1.3.5 肠毒素大肠杆菌受体基因…….

1.3.6 心脏脂肪酸结合蛋白基因……..

1.3.7 钙蛋白酶抑制蛋白基因……….

1.3.8 组织蛋白酶 D 基因……………..

1.3.9 成骨细胞特异因子基因……….

1.3.10 白色位点（KIT 基因）……….

1.3.11 肌细胞生成素基因……………

1.3.12 垂体转录因子基因…………….

1.3.13 NRAMP1 基因………………….

1.3.14 乳铁蛋白基因…………………

1.3.15 运铁蛋白基因………………..

2 材料与方法…….

2.1 试验材料….

2.1.1 试验猪种的来源及采样方法….

2.1.2 仪器设备….

2.1.3 试验试剂

2.2 试验方法 ……..

2.2.1 组织 DNA 的提取……………….. …………………...

2.2.2 DNA 质量的检测……………….. …………… ….

2.2.3 DNA 的纯化………………….

2.2.4 限制性片段长度多态性 DNA 标记分析……….

2.2.5 单链构象多态性 DNA 标记分析………………..

2.3 数据统计及分析方法 ………..

2.3.1 基因型频率和基因频率…….

2.3.2 群体遗传平衡性检验……….

2.3.3 群体遗传共适应系数的计算..

3 结果与分析….

3.1 组织中 DNA 的提取与检测….

3.2 野猪六个基因位点的 PCR-RFLP 检测结果…….

3.2.1 JAK2 基因………………….

3.2.2 肠毒素大肠杆菌受体基因…..

3.2.3 心脏脂肪酸结合蛋白基因…..

3.2.4 钙蛋白酶抑制蛋白基因…….

3.2.5 未检测到多态性的基因…………

3.3 野猪九个基因位点的 PCR-SSCP 检测结果………….

3.3.1 Nanog 基因…

3.3.2 Leptin 基因….

3.3.3 胰岛素样生长因子蛋白 3 基因..

3.3.4 未检测到多态性的基因…………

3.4 数据统计与分析………………... ...

3.4.1 单个基因位点的遗传平衡检验…

3.4.2 两个基因位点间组合的遗传平衡检测………………

3.4.3 连锁不平衡检测及遗传共适应系数的计算结果……

4 讨论……………..

4.1 限制性片段长度多态性与单链构象多态性 DNA 标记分析………………

4.1.1 限制性片段长度多态性 DNA 标记分析…………….

4.1.2 单链构象多态性 DNA 标记分析.

4.2 遗传共适应的产生背景及应用…..

4.3 遗传不平衡原因分析……………..

4.4 遗传共适应存在的主要问题…

5 结论…………….

参考文献…………………..

致谢………………..

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