[硕士论文] 5个绵羊品种GDF8区域8个微卫星的多态性及其与肉用性能的相关分析 [复制链接]

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硕士论文-5个绵羊品种GDF8区域8个微卫星的多态性及其与肉用性能的相关分析，共58页，33001字

摘 要

根据绵羊的遗传图谱及相关报道，选择了 2 号染色体 GDF8 区域可能与肉用性能相

关性较大的 8 个高度多态微卫星基因座位（BM81124，TEXAN2，FCB128，BMS1591，

ILSTS30，FCB20，TGLA10，BMS678），分析这些位点在 陶赛特、萨福克和特克塞尔

三个肉羊品种的遗传变异，选择新疆当地品种中国美利奴（肉用多胎品系）和阿勒泰羊

作为对照。结果表明，8 个微卫星座位上共检测到 64 个等位基因，等位基因数在 5~12

个之间。各基因座多态信息含量为 0.4896~0.8937，均表现出了高度多态性。各基因座杂

和度为 0.5766~0.9022，说明这些绵羊品种有着较丰富的遗传多样性。5 个绵羊品种中，

3 个肉羊品种的遗传距离相对较近，陶赛特羊与萨福克羊遗传距离最近，为 0.1843。阿

勒泰羊与萨福克羊的遗传距离最远，为 0.3377。根据遗传距离进行系统聚类分析，准确

的反映了这 5 个绵羊群体的地理分布和它们的亲缘关系。研究结果对我国肉用绵羊资源

的评估、保存和预测杂种优势具有一定的指导意义。

8 个微卫星不同基因型与三个肉羊群体（陶赛特、萨福克和特克塞尔）进行肉用性

能的最小二乘分析，结果表明：FCB128 的基因型（139/122）对眼肌面积产生正面影响，

TEXAN2 的基因型（132/116 和 125/108）对臀宽产生正面影响，位点 FCB128 的基因

型（122/108 和 119/108）对背膘厚产生正影响。表明在微卫星（TEXAN2、FCB128 和

BM81124）三个位点基因座附近可能存在影响绵羊肉用性能的 QTL 位点。

关键词：绵羊；微卫星标记；多态性;肉用性能

目录

中文摘要……...……… . …………..i

英文摘要…………..…………........ . .……ii

前言…...…1

文献综述…………..……….………2

1 微卫星标记……...…………...………..……...2

1.1 微卫星的发现……...………...…… . ………2

1.2 微卫星的形成机制及筛选方法..... ...... 2

1.3 微卫星的结构……...…… ……3

1.4 微卫星标记的特点...... ...4

1.5 微卫星标记在绵羊遗传育种中的应用 .. …………5

1.6 微卫星标记方法的局限性和不足… .......... ………9

2 GDF8 基因的研究概况………….. ………….9

2.1 GDF8 基因的发现及结构… ......... …..9

2.2 GDF8 基因的作用机制……..........………… . …..10

2.3 GDF8 基因的定位 ..... 10

3 绵羊 GDF8 基因的研究进展以及课题的提出 .......... 11

3.1 绵羊 GDF8 基因的研究进展… ....... .11

3.2 本研究课题的提出.. ....... .........12

材料和方法..........…………..13

1 实验材料.........…………...13

1.1 耳组织样…….......13

1.2 主要试剂… ........ ………13

1.3 主要仪器……… ........ …15

2 主要实验步骤………… ........ ………...13

2.1 羊的臀宽的测定….……….. .. 13

2.2 活体羊的眼肌面积和背膘厚度测定 ........ ………13

2.3 组织样中 DNA 的提取………....... ...14

2.4 微卫星 DNA 标记的选择………......... ………….14

2.5 PCR 反应条件……….........………….15

2.6 聚丙烯酰胺凝胶制备与电泳………15

2.7 银染……… ....... ………16

2.8 基因型分型…… ....... ....16

3 数据统计分析………… ........ ………...16

3.1 等位基因频率… ..... …………16

3.2 多态信息含量 ..... 17

3.3 遗传杂合度.. .... ..17

3.4 有效等位基因数…… …17

3.5 遗传距离……… . ......17

3.6 聚类分析………… ……18

3.7 微卫星标记与肉用性能的相关分析18

结果与分析… ..... …..19

1 PCR 产物的 PAGE 检测…...……....…19

2 微卫星座位的多态性统计… ........ ………..……….21

2.1 各微卫星位点的等位基因个数、大小及频率………… ..... ……….…….21

2.2 各微卫星位点在不同绵羊品种中的多态信息含量、群体杂合度及有效等位基因

数........ 24

2.3 各群体间遗传距离及系统聚类图……… . ……..25

2.4 各微卫星座位不同基因型的最小二乘与显著性检验……… ......... ……..26

讨论…… ......... .29

1 试验分析技术.......... ........ ..........29

1.1 关于抽样和样本容量问题… ………29

1.2 关于引物的设计与选择问题… ........ …..………..29

1.3 PCR 反应体系与条件的确定…..……......... …….29

1.4 PCR 产物的检测……..…….. ……...30

1.5 关于基因型判断问题……… ....... …30

2 关于群体遗传变异分析 ………...……31

3 关于群体间的遗传距离与系统发生关系分析… ........ ……...…32

4 关于不同群体微卫星基因座的遗传特性的讨论………….……… ........ …..32

5 关于标记多态性与肉用性能的相关分析……… ........ ……...…32

6 关于本实验的创新点………… .. …...35

结论..........…… ........ ………36

参考文献………37

附录42

致谢…………....45

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