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[硕士论文] 小鼠Hsp70基因序列分析及其在囊胚内表达的研究 [复制链接]

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文件大小:2.46MB
适用专业:临床兽医学
适用年级:大学
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论文编号:198494

资料简介:
硕士论文-小鼠Hsp70基因序列分析及其在囊胚内表达的研究,共68页,29251字

摘 要

TRIzol 法提取 40℃热应激 1h 小鼠肝脏总 RNA,根据 Genbank 中小鼠 Hsp70

cDNA 序列设计引物,用 RT-PCR 方法克隆了昆明小鼠 Hsp70 cDNA 全长序列

并对其进行序列和分子进化分析。同时将体外培养至囊胚的小鼠胚胎分为 7 组,

每组 50 枚。其中,40℃热应激 3 组,38℃热应激 3 组,分别应激 1h,2h,3h,

然后在 37℃条件下分别恢复 3h,2h,1h;对照 1 组,37℃培养 4h,每组进行

三个重复,然后提取胚胎细胞内总 RNA,根据所测序列和 Genbank 发表序列设

计引物,18S rRNA 引物作为内参,用半定量 RT-PCR 和实时荧光定量 RT-PCR

方法检测热应激小鼠囊胚内 Hsp70 mRNA 的表达水平。试验结果如下:

1. 用 RT-PCR 方法成功克隆了 1926bp 的 Hsp70 cDNA 全长序列,与 Genbank

已发表序列经 BLAST 分析同源性为 99.3%,共有 13 个位点发生突变,导致氨

基酸残基 7 处发生替换,氨基酸列同源性为 98.8%,但是蛋白质等电点无变化,

为 5.516。蛋白二级结构分析显示,α-螺旋占 39%,β-折叠占 10%,Turn(转

角)占 6%,Coil(无规则卷曲)占 45%。

2. 用 DNAStar protean 软件对小鼠 Hsp70 与其他各动物物种 Hsp70 进行分

子进化分析显示,小鼠 Hsp70 与大鼠 Hsp70-1A,Hsp70-1B,Hsp70,牛 Hsp70-1A,

Hsp70-1B,人 Hsp70-1A,Hsp70-1B,狗 Hsp70 同源性较高,与其他物种同源

性相对较低,与山羊 Hsp70 同源性仅为 81.1%。

3. 用 18S rRNA 做内参对小鼠热应激囊胚内 Hsp70 mRNA 的表达进行半定

量分析显示,各试验组,包括对照组都有 Hsp70 基因的表达,其中,38℃热应

激组的小鼠囊胚在热应激开始 1h 后,细胞内 Hsp70 mRNA 水平无明显变化,

热应激 2h 后 Hsp70 mRNA 达到较高水平,之后下降;40℃热应激组在热应激

开始 1h 后小鼠囊胚细胞内 Hsp70 mRNA 就达到较高水平,为对照组的 5.893 倍,

之后随热应激时间延长而下降。

4. 以 18S rRNA 做外标,用实时荧光定量 RT-PCR 定量分析了小鼠囊胚细

胞内 Hsp70 mRNA 的变化水平,结果显示,38℃ 1 h 热应激组的 Hsp70 mRNA

较对照组略有增加,仅增加 4.59 倍,热应激 2 h 后达到较高水平,是对照组的

137.19 倍,然后开始迅速下降,热应激 3h 后,下降到对照组的 29.86 倍。40℃

热应激 1 h 后,胚胎细胞内 Hsp70 mRNA 是对照组的 103.97 倍,然后随应激时

间的延长开始下降,到热应激 2 h 和 3 h 后分别下降至对照组的 51.98 倍和 27.86

倍。

上述结果说明,小鼠囊胚对热应激敏感,轻度、短时间微热应激即可启动

小鼠囊胚诱导型 Hsp70 基因高水平表达。在 38℃和 40℃热应激条件下,胚胎

细胞内 Hsp70 mRNA 分别在热应激开始后 2 h 和 1 h 达到较高水平。

关键词:小鼠;囊胚;热应激;Hsp70 基因;RT-PCR;荧光定量 RT-PCR

目录

中文摘要 .............1

英文摘要 .............3

缩略符号 ...........Ⅰ

文献综述 ............. 1

1 前言 ... 1

2 早期胚胎发育与胚胎基因组的表达........ 1

2.1 早期胚胎发育 ............ 1

2.2 胚胎基因组的表达 .... 2

3 热应激与热休克蛋白 70 ............ 3

3.1 热应激与热休克反应 3

3.2 热休克蛋白概述 ........ 4

3.3 热休克蛋白 70 的分类 ............ 4

3.4 热休克蛋白 70 的生物学特性. 5

3.5 热休克蛋白 70 表达的基因调控........... 5

3.6 热休克蛋白 70 的生物学功能. 6

4 热休克蛋白 70 与早期胚胎发育 7

4.1 体内发育胚胎中热休克蛋白 70 的表达............. 8

4.2 体外培养胚胎中热休克蛋白 70 的表达............. 8

研究内容

试验一 小鼠 Hsp70 cDNA 的克隆与序列分析 ..... 10

1 试验材料 ....... 10

1.1 试验动物 .... 10

1.2 试剂 ............ 10

1.3 仪器设备 .... 11

2 试验方法 ....... 11

2.1 引物的设计与合成 .. 11

2.2 TRIzol 法提取肝脏细胞总 RNA.......... 11

2.3 RT-PCR 反应 ............. 12

2.4 Hsp70 基因的克隆与序列分析 ............ 13

3 结果 . 15

3.1 PCR 扩增结果 ........... 16

3.2 单菌落 PCR 结果 ..... 16

3.3 质粒双酶切鉴定 ...... 16

3.4 测序结果与同源性分析 ........ 17

3.5 小鼠 Hsp70 的氨基酸序列与分子进化分析 .... 20

3.6 Hsp70 基因的二级结构分析 .. 23

4 讨论 . 24

试验二 热应激处理小鼠囊胚 Hsp70 mRNA 的表达.......... 26

1 试验材料 ....... 26

1.1 试验动物 .... 26

1.2 试剂与仪器 27

2 试验方法 ....... 27

2.1 胚胎体外培养 .......... 27

2.2 胚胎分组与体外热应激 ........ 27

2.3 RT-PCR 检测 ............. 27

2.4 Hsp70 基因片段的克隆与序列分析 .... 29

2.5 灰度扫描与数据分析 ............ 30

3 结果 . 30

3.1 PCR 扩增产物的电泳结果 ..... 30

3.2 Hsp70 基因克隆的鉴定结果 .. 31

3.3 测序结果 .... 31

3.4 Hsp70 mRNA 表达的半定量分析........ 32

4 讨论 . 32

试验三 荧光定量 RT-PCR 检测热应激小鼠囊胚 Hsp70 mRNA 的表达 ..... 34

1 试验材料 ....... 34

1.1 材料 ............ 34

1.2 试剂与仪器 34

2 试验方法 ....... 34

2.1 胚胎体外培养与热应激 ........ 34

2.2 引物的设计与合成 .. 35

2.3 胚胎细胞总 RNA 的提取与反转录 .... 35

2.4 实时荧光定量 PCR.. 35

3 结果 . 35

3.1 实时荧光定量 RT-PCR 荧光曲线与熔解曲线 . 35

3.2 Hsp70 基因表达水平的变化 .. 37

4 讨论 . 38

结论 ........... 40

参考文献 ........... 41

致谢 ..... 46

附录 ............. 47

攻读硕士学位期间发表的学术论文 ......... 52


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